Группа ученых из Китая провела исследование генетических образцов из окружающей среды в Гонконге, чтобы оценить, как микробы приспособились к городским условиям. В этом исследовании был сделан анализ 738 образцов с различных поверхностей в городе, в том числе метро, пирсов и с человеческой кожи. Из 738 образцов 373 считались представляющими новые виды. Большая часть собранного генетического материала из образцов принадлежала бактериям (в среднем 99,6 ± 0,35%) с незначительной долей архей (0,14 ± 0,11%) и вирусов (0,27 ± 0,32%). Микробиом воздуха метро содержал наибольшее количество видов микроорганизмов, микробиом поверхности пирса был самым разнообразным и равномерным, а микробиом кожи был наименее разнообразным и наиболее неравномерным. (1)
У некоторых из бактерий обнаружены гены, помогающие им выживать в среде с дезинфектантами. Например, бактерия типа Eremiobacterota рода Candidatus, которая ранее была обнаружена методом метагенома только в Антарктиде, смогла адаптироваться к новым условиям и имела гены, необходимые для очистки следовых газов, таких как водород, оксид углерода и диоксид углерода в окружающем воздухе, а также других следовых органических соединений (в том числе, спирта, который является ключевым ингредиентом многих дезинфицирующих средств для рук). В дополнение к этому бактерия имела гены, необходимые для метаболизма серы и аммиака (аммиак и его производные входят в состав некоторых дезинфектантов и чистящих средств).
А образцы из сточных вод, принадлежащие роду Saccharimonas, показали дополнительные или новые гены, участвующие в метаболизме основных микроэлементов, которые могут использоваться в качестве антиоксидантов для защиты клеток от окислительного повреждения, а также уникальные гены, связанные с устойчивостью к токсичным металлам.
Также команда ученых обнаружила новый штамм рода Pseudomonas, который несет большое количество генов, связанных с устойчивостью к противомикробным препаратам (AMR).
«Длительное воздействие неоптимальных концентраций дезинфицирующих средств может спровоцировать эволюцию микроорганизмов, в результате чего некоторые микробы выработают устойчивость и даже начнут использовать дезинфицирующие средства в качестве источника энергии», — рассказал доктор Тонг изданию MailOnline. (2).
Результаты данного исследования помогут в дальнейшем изучении механизмов адаптации бактерий к изменениям внешней среды и приобретении устойчивости к антисептическим и антибактериальным средствам.
1. https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-024-01926-6